非淋菌性尿道炎 (nongonococcal urethritis，NGU) 是男性常见的泌尿生殖道疾病，泛指除淋球菌以外的其他病原体感染而引起的尿道炎。非淋菌性尿道炎通常在不安全性接触 (包括阴道交、肛交或口交期间的体液交流中传播。
非淋菌性尿道炎通常由细菌感染引起，但亦可以由病毒或微生物引起。
研究指出，沙眼衣原体 ( chlamydia trachomatis， CT)、生殖支原体 ( Mycoplasma Genitalium，MG)、解脲脲原体(Ureaplasma Urealyticum，UU)和人型支原体 (Mycoplasma Hominis，MH)是非淋菌性尿道炎 最常 见 的 病 原 体。其 中，沙眼衣原体感 染 率 为 11% – 50%，生殖支原体 为 6% – 50%，解脲脲原体 为 11% – 26%，人型支原体 为 1% – 4.1%。其他非淋菌性尿道炎病原体还包括微小脲原体 (Ureaplasma Parvum，UP)、腺病毒 (Adenoviruses) 、阴道毛滴虫(Trichomonas Vaginalis，TV) ，单 纯 疱 疹 病 毒 (Herpes Simplex Virus， HSV) 、副流感嗜血杆菌 (Haemophilus Parainfluenzae) 等。
衣原体
衣原体感染 (又名披衣菌感染) 是导致非淋菌性尿道炎的最常见原因 (患者当中约50％被验出有衣原体)。衣原体感染主要由名为衣原体的病原体引起。根据世界卫生组织 估计，每年约有 9 200 万新发病例。衣原体是一种细菌，存活于患者的体液，包括精液和阴道分泌物等，同时存活于子宫颈的细胞内、尿道及直肠，有时亦存在于喉咙和眼睛。衣原体很容易透过性接触传播，故所有性活跃人士，就算没有多个性伴侣，如接触到带菌者的体液分泌，都有机会被衣原体感染或把细菌传播。
衣原体可侵袭阴茎、阴道、子宫颈、子宫、肛门，衣原体也可感染覆盖眼白（结膜）和咽喉的粘膜。不论男性或女性，感染衣原体后若不接受治疗，可引起严重的性器官感染：
盘腔炎可导致女性不育。此外，感染衣原体会增加女性患上子宫颈癌及宫外孕的可能性。若孕妇感染衣原体，可在分娩把衣原体传染给婴儿，新生婴儿可能会得严重眼结膜炎及肺炎而引致永久性伤害。
感染衣原体，患者一般没有明显病征，高达80%的女性和25%的男性感染衣原体后并无明显症状，即使染病亦不察觉和没有接受治疗，因此感染者往把衣原体传染了性伴侣而不自知。然而，如果患者及早接受治疗，衣原体并非不治之症，患者服用经由医生处方的抗生素可以治愈。此外，每次性接触时正确使用安全套，亦可以减低受衣原体感染的机会。
支原体
支原体是一种没有细胞壁的细菌，比一般细菌微细，常寄居在人体的各个部位。支原体有200多种，大部份都无害，然而当中的肺炎支原体(Mycoplasma Pneumoniae)、生殖支原体、人型支原体、解脲支原体、微小脲原体(Ureaplasma Parvum)可导致严重的后果。生殖器支原体、人型支原体、解脲支原体及微小脲原体会经性接触传染，并引起泌尿生殖道感染或其他身体问题：
如孕妇感染支原体，有机会导致宫外孕、早产或流产，孕妇在怀孕或生产时，亦有机会把支原体感染婴儿，使新生儿出现体重不足、肺炎或败血症。
